Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms