Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms