Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms