Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nedd1P33215 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nedd1P33215 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nedd1P33215 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nedd1P33215 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nedd1P33215 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nedd1P33215 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nedd1P33215 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nedd1P33215 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms