Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Hoxd10P28359 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxd10P28359 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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