Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Myf5P24699 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms