Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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