Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms