Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms