Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ntf3P20181 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms