Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18532 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18532 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18532 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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