Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P18530 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18530 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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