Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18526 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18526 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms