Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PcnaP17918 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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PcnaP17918 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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PcnaP17918 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms