Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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