Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ApcsP12246 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
ApcsP12246 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms