Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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P10404 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P10404 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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