Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
CrygdP04342 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms