Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01649 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01649 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms