Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CrxO54751 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CrxO54751 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CrxO54751 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CrxO54751 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms