Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms