Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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