Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk2O35491 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms