Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Edil3O35474 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Edil3O35474 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms