Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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