Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ascl4M0QW46 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms