Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm20878L7N244 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm20878L7N244 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm20878L7N244 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm20878L7N244 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20878L7N244 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20878L7N244 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20878L7N244 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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