Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3542K7N6U2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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