Protein–RNA interactions for Protein: J3QPN2

Gm21870, Predicted gene, 21870, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21870J3QPN2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21870J3QPN2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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