Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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