Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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