Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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