Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E030018B13RikJ3QMS9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms