Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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