Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms