Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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