Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm21818J3KMS6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm21818J3KMS6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm21818J3KMS6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm21818J3KMS6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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