Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21719J3KMI9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms