Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm20696H3BJN7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms