Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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