Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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