Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29094F6Q785 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms