Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col22a1E9Q7P1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms