Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Susd1E9Q3H4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Susd1E9Q3H4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms