Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Gcn1E9PVA8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Gcn1E9PVA8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Gcn1E9PVA8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Gcn1E9PVA8 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Gcn1E9PVA8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Gcn1E9PVA8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Gcn1E9PVA8 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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