Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Vpreb3D3Z6J4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms