Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm3543D3Z235 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3543D3Z235 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3543D3Z235 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3543D3Z235 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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