Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms