Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm21049-201ENSMUST00000197078 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms