Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Odf2A3KGV1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms